Кафедра педиатрии с курсом неонатологии основана 1 сентября 1985 года в составе факультета усовершенствования врачей Кубанского медицинского института. С 1985 года по 2008 год кафедру педиатрии с курсом неонатологии ФПК и ППС возглавлял профессор Л.А. Никулин.
С 2008 года кафедру педиатрии с курсом неонатологии ФПК и ППС возглавляет Клещенко Елена Ивановна доктор медицинских наук, профессор, главный врач ГБУЗ «Детская краевая клиническая больница», главный педиатр Краснодарского края, председатель регионального отделения Союза педиатров России. Является председателем Наблюдательного совета благотворительного фонда «Край Добра». Член ученого совета КубГМУ. Член центрального методического совета КубГМУ, член центральной проблемной комиссии. Председатель экспертной группы центральной аттестационной комиссии Министерства здравоохранения Российской Федерации в Южном федеральном округе по профилю «педиатрия». Член комиссий Министерства здравоохранения Краснодарского края. Заслуженный работник здравоохранения Кубани.
На кафедре работают доценты: к.м.н. Д.А. Каюмова, к.м.н. М.Г. Кулагина; к.м.н. М.П. Яковенко, к.м.н. Е.В. Шимченко, ассистенты: Е.П. Апалькова, Е.В. Боровикова, к.м.н. А.Ф. Комаров, внешние совместители: доцент, к.м.н. М.А. Литвинская главный врач “ООО СЛМедикалГруп”; ассистенты: к.м.н. И.Ю. Черняк (главный внештатный детский специалист эндокринолог, заведующий эндокринологическим отделением ГБУЗ ДККБ МЗ КК), О.И. Сапун (главный внештатный специалист неонатолог, заведующий отделением реанимации и интенсивной терапии новорожденных № 2 ГБУЗ ДККБ МЗ КК), к.м.н. В.В. Лебедев (главный внештатный детский специалист гематолог, заведующий отделением онкологии и гематологии с химиотерапией ГБУЗ ДККБ МЗ КК), Н.В. Сидорова (главный внештатный детский специалист кардиолог, первый заместитель главного врача ГБУЗ ДККБ МЗ КК), к.м.н. Н.В. Бойко (заведующий отделением патологии новорожденных и недоношенных детей №1 ГБУЗ ККБ№2 МЗ КК), В.Е. Харченко (заместитель главного врача по детству и родовспоможению ГБУЗ ГП№8 МЗ КК), И.А.Токовая (заведующий отделением реанимации и интенсивной терапии новорожденных №2 ГБУЗ ККБ№2 МЗ КК), А.А. Тетенкова (главный врач ГБУЗ ДГКБ№1 МЗ КК).
Сотрудники активно занимаются научной деятельностью: написанием статей, тезисов, выступлением на конференциях. Кафедра организовывает краевые, межрегиональные, всероссийские, междисциплинарные научные конференции, они проходят как в очном, так и в онлайн формате.
На кафедре проводятся циклы повышения квалификации, профессиональной переподготовки в рамках непрерывного медицинского образования (НМО) для врачей педиатров, неонатологов, детских кардиологов, детских онкологов-гематологов и для среднего медицинского персонала. Проходят обучение ординаторы и аспиранты по педиатрии и неонатологии. Занятия для всех обучающихся осуществляются с применением симуляционного центра на базах университета: ФГБОУ ВО КубГМУ МЗ РФ Мультипрофильный аккредитационно-симуляционный центр, Клиника ФГБОУ ВО КубГМУ МЗ РФ.
Для осуществления лечебной работы сотрудниками кафедры педиатрии с курсом неонатологии задействовано большое количество баз: ГБУЗ ККБСМП г.Краснодара, ГБУЗ Детская краевая клиническая больница МЗ КК, ГБУЗ Детская городская клиническая больница №1, ГБУЗ Краевая клиническая больница №2 МЗ КК, ГБУЗ Специализированная клиническая детская инфекционная больница МЗ КК. Так же базами кафедры являются детские поликлиники г. Краснодара, МБУЗ г. Сочи «Центр медицинской профилактики»; МБУЗ «Детская ГБ УЗА МО город-курорт Анапа».
Сотрудники кафедры выполняют большой объем лечебной работы: обходы больных, участие в консилиумах, проводят консультации, занимаются экспертной оценкой качества медицинских карт, проводят научно-медицинскую экспертизу, являются членами ОКРЭ и ПИЛИ ГБУЗ ДККБ МЗ КК и ГБУЗ БСМП г. Краснодара.