Педиатрический факультет был организован в Кубанском государственном медицинском институте им. Красной Армии 1 сентября 1969 года. Первым педиатрическим структурным подразделением, созданным на факультете, стала кафедра пропедевтики детских болезней с факультетской педиатрией в 1972 году, которую возглавил доцент В.П. Настенко.
Основными сотрудниками кафедры, в то время, были ассистенты: В.А. Самаркин, Л.В. Сидельникова, Л.А. Никулин, Л.М. Кравченко А.Г. Алдатов.
Долгое время научным направлением кафедры была тема «Санаторно-курортный этап реабилитации детей в условиях морского климата». Результатом работы явилась защита нескольких кандидатских и одной докторской диссертации (В.П. Настенко), которые легли в основу разработанных показаний и противопоказаний для направления детей на курорт Анапа как Всесоюзную детскую здравницу России.
С 1990 по 2000 год преподавательский состав кафедры пополнился замечательными молодыми клиницистами Л.А. Харитоновой, Н.Н. Щеголеватой, Т.В. Сундатовой, Э.М. Шадриной. С 2004 года указанная кафедра была преобразована в кафедру педиатрии №1, где были защищены: 8 диссертаций на соискание учетной степени кандидата медицинских наук (Д.Н. Ткаченко, В.А. Шашель, В.Г. Назаретян, Л.В. Макрушина, Н.В. Левицкая, Н.П. Биленко, Э.М. Шадрина и др.), 4 диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук (М.Ю. Юсупов, В.А. Шашель, В.Г. Назаретян, Н.П. Биленко).
По результатам трудов В.П. Настенко было опубликовано 200 научных работ, 6 патентов на изобретение, 3 авторских свидетельства, 6 монографий, 13 методических пособий для врачей и студентов.
С 2008 года кафедру возглавляла доктор медицинских наук, профессор В.А. Шашель. В 2004 году она защитила диссертацию на соискание ученой степени доктора медицинских наук «Болезни органов пищеварения у детей Краснодарского края (клинико-эпидемиологические и экологические особенности)». В арсенале ее научной работы 287 статей, 32 учебно-методических пособия, 20 монографий, 7 патентов, 3 авторских свидетельства. Под руководством В.А. Шашель кафедральными сотрудниками разрабатывались следующие направления: проблемы экологической педиатрии, совершенствование профилактических и реабилитационных мероприятий для детей и подростков Краснодарского края с хроническими заболеваниями. Продолжается изучение санаторно-курортной реабилитации детей с заболеваниями органов пищеварения, дыхания, сердечно-сосудистой системы, железодефицитными состояниями. На кафедре сформирован творческий коллектив, способный решать сложные и актуальные задачи педиатрии. Педагогической, научной и лечебной деятельностью занимаются 2 профессора (В.А. Шашель, В.Г. Назаретян), 5 доцентов (В.Н. Фирсова, Э.М. Шадрина, Н.Г. Лупаш, М.М. Трубилина), 3 ассистента (П.В. Левин, С.Ю. Маталаева Л.А. Подпорина).
Базами для выполнения лечебной работы сотрудников являются: детский консультационный диагностический центр Детской краевой больницы, детские поликлиники № 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 и 27.
Сотрудники кафедры занимаются лечебной работой как специалисты врачи-педиатры, гастроэнтерологи, аллергологи. Осуществляют консультативную, лечебную работу, выполняют экспертизу качества ведения истории болезни в стационаре.
За 50 лет работы кафедры педиатрии №1, подготовлено 5 докторов наук, 20 кандидатов наук, обучены 102 клинических ординатора, 198 врачей-интернов. Научные исследования опубликованы в виде более одной тысячи тезисов и статей, написано и издано 83 учебно-методические рекомендации для врачей и студентов, 28 монографий, учебник «Основы формирования здоровья детей», 15 патентов и 3 авторских свидетельства на изобретение. На регулярной основе кафедра организует научно-практические конференции для врачей практического здравоохранения.