Впервые курс онкологии в Кубанском мединституте был создан в 1975 году, на кафедре госпитальной хирургии, доцентом А.Я. Назаровым с базой в Краевом клиническом онкологическом диспансере. В тот момент преподавателями работали В.М. Мавроди, Б.Я. Каушанский и И.А. Санкин. Научным приоритетом сотрудников курса онкологии была разработка новых способов лечения и изучение результатов в органосохраняющей хирургии рака гортани и прямой кишки.
В октябре 1997 году курс онкологии был преобразован в кафедру онкологии с курсом торакальной хирургии ФПК и ППС под руководством профессора В.А. Порханова. За последнее десятилетие на кафедре защищено более 20 кандидатских и 2 докторских диссертации, выпущено более 200 статей в российских и международных журналах, издано 5 монографий, зарегистрировано 3 патента и 1 открытие. Приоритетными научными направлениями являются разработка и изучение расширенных и комбинированных операций по поводу злокачественных новообразований органов грудной клетки и брюшной полости, хирургия трахеи, магнитотерапия в комбинированном лечении рака молочной железы и легких.
На кафедре преподают четыре доктора медицинских наук: профессор В.А. Порханов, профессор Н.Г.Бахмутский, А.П.Сельващук, Н.В.Порханова.
Доктора медицинских наук: В.Н.Бодня, А.Г.Барышев.
Кандидаты медицинских наук: А.Д.Гащенко, И.С.Поляков, Б.М.Самойлик.
За годы существования курса и кафедры прошли обучение более 40 клинических ординаторов и аспирантов, пять из которых занимают должности заведующих отделениями в лечебных учреждениях Краснодарского края. Сотрудники кафедры проводят большую лечебную работу, среди них есть главный врач, заместитель главного врача, заведующие отделениями, старшие ординаторы отделений, главные внештатные специалисты департамента здравоохранения Краснодарского края.