В 1997 году окончил Кубанскую государственную медицинскую академию по специальности «Лечебное дело», в 1998 году – интернатуру по специальности «Акушерство и гинекология».
В 2012 году присвоена ученая степень доктора медицинских наук.
Имеет подготовку по специальности «Организация здравоохранения и общественное здоровье», высшую квалификационную категорию по специальностям «Акушерство и гинекология» и «Организация здравоохранения и общественное здоровье».
Свою трудовую деятельность начал в 1997 году в должности врача-акушера-гинеколога Родильного дома города Сочи.
С февраля 2004 года по апрель 2007 года работал в должности заведующего отделением Перинатального центра города Сочи.
С апреля 2007 года по ноябрь 2009 года занимал должность заместителя главного врача Перинатального центра города Сочи.
С ноября 2009 года по сентябрь 2010 года возглавлял Перинатальный центр города Сочи, с сентября 2010 года по июль 2013 года − Городскую больницу № 9 города Сочи.
В июле 2013 года назначен министром здравоохранения Краснодарского края.
С 2015 года возглавляет кафедру клинической иммунологии, аллергологии и лабораторной диагностики ФПК и ППС.
Евгений Федорович автор 55 научных статей, 4 учебных пособий.