История становления кафедры хирургической стоматологии уходит истоками в развитие стоматологии на Кубани. После Великой Отечественной войны в Краснодаре была только одна зубоврачебная поликлиника, где работало 20 зубных врачей и 3 стоматолога. Хирургическая стоматологическая помощь оказывалась на поликлиническом приеме и сводилась к удалению зубов и проведению амбулаторных операций. Больным с тяжелыми воспалительными процессами, травматическими повреждениями челюстно-лицевой области и т.п. стоматологическая помощь оказывалась общими хирургами. Подготовка стоматологических кадров до 1963 года проводилась в зубоврачебной школе в г.Краснодаре. Число стоматологов в Краснодарском крае к 1950 году составляло по отношению к зубным врачам лишь 12%.
Для оказания стационарной помощи челюстно-лицевым больным в 1952 году в Краснодаре на базе хирургического отделения Краевой клинической больницы и кафедры госпитальной хирургии Кубанского мединститута были выделены вначале 5, затем 10 коек.
На кафедре госпитальной хирургии в 1953 году был открыт курс стоматологии на лечебном факультета, который возглавлял с 1953 по 1959 годы доцент Бернадский Юрий Иосифович. По инициативе главного стоматолога Краснодарского края Долгих Лидии Михайловны и доцента Ю.И. Бернадского в 1956 году на базе Краевой стоматологической поликлиники был открыт челюстно-лицевой стационар на 25 коек (по ул.Красноармейской, 60). Под руководством Ю.И. Бернадского практические врачи Л.М. Долгих, В.А. Киселев, В.П. Ковчун и В.П. Батиевская проводили научные исследования, результаты которых были обобщены в защищенных кандидатских диссертациях. Ю.И. Бернадский как руководитель, педагог, ученый, челюстно-лицевой хирург отличался высокой трудоспособностью, требовательностью к себе и подчиненным, оказывал непосредственную помощь в профессиональном росте молодых хирургов.
В истории Кубанского медицинского института 1963 год знаменателен тем, что в нем начал функционировать новый факультет – стоматологический. В открытии факультета и его формировании основополагающую роль сыграл талантливый ученик профессора Ю.И. Берадского – доцент Киселёв Виктор Андрианович, сменивший профессора Ю.И. Берадского на должности заведующего курсом стоматологии на кафедре госпитальной хирургии в 1959 году. В 1965 году на стоматологическом факультете была открыта объединенная кафедра стоматологии, заведующим которой был избран доцент В.А. Киселёв, а доцентские курсы на кафедре по терапевтической и ортопедической стоматологии заняли соответственно доцент М.М. Царинский, доцент И.Х. Пинский. Первым деканом стоматологического факультета был назначен доцент В.А. Киселёв.
В качестве преподавателей на кафедру стоматологии были приглашены Батиевский П.А., Сергичева Н.В., Шафранова-Батиевская В.П. В аспирантуру были приняты врачи Пронина В.П., Латий З.П., Баронов А.И. С таким небольшим коллективом кафедра начала преподавание профильных дисциплин. В качестве учебной базы кафедре стоматологии были предоставлены отделения Краевой стоматологической поликлиники (хирургическое, терапевтическое, ортопедическое) по ул.Красноармейская, 60.
Важным событием в жизни института и факультета стала организация в 1966 году трех профильных кафедр: хирургической, терапевтической и ортопедической стоматологии. Кафедру хирургической стоматологии возглавил доцент Киселёв В.А. (с 1972 года – доктор медицинских наук, профессор). Первыми преподаватели кафедры были подготовлены из практических врачей: Шафранова-Батиевская В.П., Ковчун В.П., Долгих Л.М., Свешникова Р.А., Баронов А.И., Киселева Н.Ф., Шульженко В.И., Зак В.А. Позднее кафедру пополнили преподаватели из числа выпускников стоматологического факультета Кубанского медицинского института им. Красной Армии: Авакимян М.А., Неделько Н.А., Старченко О.Д., Волков В.А., Свешников Г.Г., Аракелян А.Р., Таранов В.Ю., Цымбалов О.В., Гайворонская Т.В., Уварова А.Г., Мануйлова М.В., Ловлин В.Н., Кузьмин М.И., Гербова Т.В., Таранова Н.Ю., Демченко В.А., Шафранова С.К. и другие.
Параллельно с формированием кадрового потенциала кафедры улучшалась и материальная база. В 1968 году при активной инициативе главного врача Краевой стоматолгической поликлиники Долгих Л.М. и профессора Киселёва В.А. было построено и введено в строй здание челюстно-лицевого стационара (на 60 коек) и амбулаторного хирургического отдления, где была размещена кафедра хирургической стоматологии по ул.Шаумяна (Рашпилевская), 31.
Профессор Киселёв В.А. бессменно руководил кафедрой до марта 1993 года, до последнего дня жизни. Под его руководством защищено 19 кандидатских и 2 докторские диссертации. По его инициативе открыты 2 кафедры: кафедра стоматологии факультета повышения квалификации и кафедра стоматологии детского возраста, которые возглавили его ученики профессор Баронов А.И. и доцент Шульженко В.И. В память о нем установлена мемориальная доска.
С 1993 по 2009 год кафедру возглавлял один из лучших учеников профессора Киселёва В.А. – доктор медицинских наук, профессор Николай Андреевич Неделько, в 1986–1988 годах он был деканом стоматологического факультета, а с 1988 по 1991 годы – проректором по учебной работе. Под его руководством защищены 2 докторских и 9 кандидатских диссертаций.
В настоящее время кафедрой заведует доктор медицинских наук профессор Татьяна Владимировна Гайворонская. Кафедра является учебно-методическим центром для практического здравоохранения: ведется подготовка аспирантов, клинических ординаторов, в том числе из зарубежных стран; ежегодно около 20 врачей хирургов-стоматологов и челюстно-лицевых хирургов проходят курсы усовершенствования.