Среди подразделений университета в числе первых была создана кафедра глазных болезней. Ее организатором и первым руководителем в 1920 году стал заведующий глазным отделением бывшей 3-й городской больницы (ныне детская краевая больница) известный врач, доктор медицины Станислав Владимирович Очаповский, который руководил ею до 1945 года. За 35 лет работы заведующим отделением и 25 лет работы заведующим кафедрой С.В. Очаповским опубликованы 112 работ. Первым ассистентом кафедры была А.М. Привалова, работавшая с 1918 года ординатором глазного отделения. В разное время до 1945 года ассистентами состояли Р.Г. Берберов, А.А. Гюльназарьянц, М.З. Попов, Н.М. Павлов, И.А. Шарковский, Н.В. Очаповская, В.А. Кузнецов, А.И. Липовская, Я.Г. Хазаров. В этот период выполнены и защищены две кандидатские (Н.В. Очаповская, 1941; В.В. Назаров, 1941) и одна докторская диссертация (Н.В. Очаповская, 1947).
В течение 20 лет (1945–1965) кафедрой заведовала профессор Надежда Васильевна Очаповская. В это время на кафедре работали ассистенты А.И. Липовская и Н.А. Юшко.
В 1965 году кафедру возглавляла кандидат медицинских наук Ариадна Ильинична Липовская.
С 1965 по 1981 год – профессор Надежда Авраамовна Юшко. В 1966 году ей было присвоено звание доцента. В этот период ассистентами работали А.И. Липовская, Л.И. Пескова, В.А. Эмилит, Л.Ф. Лазаренко, Л.А. Каленич, В.И. Колосов, О.П. Воложенина. В 1970 году доцентом кафедры избирается Л.И. Пескова. В эти годы выполнены три докторские (Н.А. Юшко, 1970; Н.И. Кучерявый, 1972; Л.Ф. Лазаренко, 1975) и семь кандидатских диссертаций (Л.Ф. Лазаренко, 1967; В.Ф. Гроец, 1969; В.И. Колосов, 1969; Л.А. Каленич, 1971; О.П. Воложенина, 1975; Л.А. Золотарев, 1980; О.С. Мошников, 1981).
С 1981 по 1986-й кафедрой заведовал профессор Николай Иванович Кучерявый, а с 1986 по 1989 год – доцент Лидия Иосифовна Пескова. На кафедру приходят два новых ассистента – Л.А. Золотарев и В.Н. Курочкин.
С 1989 по 2010-й во главе кафедры стоял профессор Александр Иванович Еременко, заслуженный работник здравоохранения Кубани и Республики Адыгея, заслуженный деятель науки и образования, заслуженный врач РФ, действительный член (академик) Международной академии имплантатов с памятью формы, академик РАЕ, член-корреспондент РАЕН. Он является автором 532 научных работ, 11 изобретений.
В 2010 году кафедру возглавил директор Краснодарского филиала ФГБУ «МНТК «Микрохирургии глаза» им. акад. С.Н. Федорова» Минздрава России, заслуженный врач РФ, председатель межрегионального Совета ООР по ЮФО, академик РАЕН, к.м.н., к.э.н. – Сергей Николаевич Сахнов. Автор 250 научных работ, 4 монографий и 11 сборников научных трудов; 25 статей в реферируемых журналах из списка ВАК РФ; 20 изобретений; 10 методических пособий. В 2004 г. С.Н. Сахнов был награждён медалью «За благородные помыслы и достойные деяния». Стаж работы в системе здравоохранения составляет более 30 лет.
В настоящее время в штате кафедры: пять доцентов – А.Г. Заболотний – зав. научным отделом ФГБУ «МНТК «Микрохирургии глаза» им. акад. С.Н. Федорова» Минздрава России, заслуженный врач Кубани, к.м.н.; Л.А. Каленич к.м.н.; О.И. Лысенко к.м.н.; А.В. Малышев – зав. глазным микрохирургическим отделением ГБУЗ ККБ№1 им. проф. С.В. Очаповского министерства здравоохранения Краснодарского края, главный внештатный специалист МЗ КК – главный офтальмолог, «Лучший врач 2009 года» в номинации « Лучший врач офтальмолог», к.м.н.; С.В. Янченко д.м.н.; три ассистента – З.Ж. Аль-Рашид к.м.н.; Л.А. Басинская к.м.н.; Н.Ю. Калинина – младший научный сотрудник научного отдела ФГБУ «Микрохирургии глаза» им. акад. С.Н. Федорова» Минздрава России; Т.Г. Катханов к.м.н.; Т.М. Тихонова; старший лаборант Т.М. Тихонова; лаборанты – Л.М. Карданова, Т.П. Князева.