Кафедра гистологии начала работу с момента открытия медицинского факультета Кубанского университета. Ее организатором и первым заведующим был профессор Владимир Яковлевич Рубашкин – выдающийся гистолог, известный своими работами по морфогенезу половой и нервной систем. Перу В.Я. Рубашкина принадлежит обстоятельное руководство «Основы гистологии и гистогенеза человека».
С 1922 года заведующим кафедрой был утвержден профессор Петр Яковлевич Лаховский, многое сделавший для расширения кафедры и оборудованной при ней лаборатории. В 1930–1931 годах заведование было поручено ассистенту А.А. Овчарову. С 1931 по 1941 год кафедрой заведовала доцент М.С. Рогозина. В этот период кафедра вела исследовательскую работу в области сравнительной гистологии пищеварительного тракта.
Во время первой эвакуации института в годы войны в ноябре 1941 года в г.Ереван кафедру возглавляла кандидат биологических наук доцент Галина Федоровна Березенцева. В дни повторной эвакуации института в г.Тюмень до ноября 1943 года кафедрой заведовал представитель ростовской школы гистологов профессор Федор Андреевич Дурицын, работавший в этой должности и после возвращения института в Краснодар до безвременной смерти в 46 лет в 1951 году.
В марте 1951 года по предложению Ф.А. Дурицина на должность ассистента кафедры был приглашен М.Г. Шубич.
После смерти профессора Ф.А. Дурицына с июля 1951 года (до выхода на пенсию в середине 1961 года) кафедрой заведует доцент Г.Ф. Березенцева, автор известных работ по миогенезу. Ее сменил Моисей Григорьевич Шубич, который в 1967 году защищает докторскую диссертацию «Цитохимия нейтрофильных лейкоцитов в норме и патологии».
В 1976 году после успешной защиты докторской диссертации Г.М. Могильная переходит на должность профессора кафедры гистологии и совместно со своим учителем активно участвует в развитии различных аспектов научной проблематики кафедры и совершенствовании учебного процесса. В 1990 году ей поручается заведование кафедрой.
Коллективом кафедры проведены комплексные патоморфологические и гистохимические исследования по космической биологии и медицине. Результаты изучения пищеварительной системы животных, экспонированных на спутниках серии «Космос», включены в приоритетные отечественные публикации по космической биологии. Ведется интенсивная разработка темы «Морфологические и гистохимические особенности покровных и железистых эпителиев органов пищеварительной системы при заболеваниях и после хирургической коррекции». Успешно продолжается творческое сотрудничество с клиническими кафедрами: детских болезней (диссертация соискателей Н.Н. Щеголеватой, Д.В. Сутуловой, Али Салман) и глазных болезней (диссертация соискателя А.Н. Стеблюк). По результатам проведенных исследований опубликовано 155 научных работ, а также сделаны 23 доклада на научных конференциях.
Научно-исследовательская, учебная, педагогическая работа кафедры гистологии осуществляется уже более 80 лет. Изданы монография и более 1200 статей, сделан ряд изобретений, подготовлены 13 докторов и 61 кандидат наук. Гистохимические исследования кафедры гистологии завоевали в этой отрасли науки высшей медицинской школе Кубани приоритетное положение.