Первый набор студентов на стоматологический факультет насчитывал 56 человек. В 1968 году состоялся первый выпуск врачей-стоматологов Кубанского медицинского института.
Завершением формирования штата факультета явилось создание в 1998 году еще одной профильной кафедры — пропедевтической стоматологии под руководством профессора Л.А. Скориковой.
С первых дней организации факультета параллельно с учебно-методической работой сотрудники кафедр приступили к выполнению научных исследований. За эти годы основной комплексной темой научных исследований факультета стала, главным образом, диагностика, профилактика и лечение воспалительных процессов челюстно-лицевой области.
Коллектив кафедр факультета, имеющий в своем составе 6 докторов и 46 кандидатов наук, способен решать самые сложные задачи. За годы своей деятельности стоматологический факультет подготовил и выпустил более 4500 врачей-стоматологов.
С 2000 года факультет реализует план образовательного стандарта нового поколения, предусматривающий углубленное изучение пропедевтической и клинической стоматологии. На профильных кафедрах факультета подготовлены и внедрены в учебный процесс новые рабочие программы.
Основной задачей факультета по качественному обучению студентов было и остается развитие клинического мышления. На всех профильных стоматологических кафедрах постоянно проводятся мероприятия по разработке и внедрению в учебный процесс новых форм, методов и средств активации познавательной деятельности студентов. На кафедрах ортопедической стоматологии, пропедевтики и профилактики стоматологических заболеваний созданы фантомные классы для самостоятельной работы студентов. Большое внимание на факультете уделяется производственной практике студентов.