Специализация факультета — общая гигиена (коммунальная гигиена, гигиена питания, гигиена детей и подростков, гигиена труда, радиационная гигиена), эпидемиология, клинико-лабораторная диагностика, а также бактериология, вирусология, паразитология и энтомология.
Студенты обучаются на 41 кафедре. Из 335 человек штатного профессорско-преподавательского состава — 52 доктора наук, 212 кандидатов наук.
К преподавательской деятельности на факультете привлекаются ведущие специалисты Управления Роспотребнадзора Краснодарского края и ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае».
Сотрудниками кафедр, на которых обучаются студенты медико-профилактического факультета, издано 4 учебника, 13 монографий, более 30 учебно-методических пособий, в том числе, утвержденных УМО по фармацевтическому и медицинскому образованию.
С учетом специфики факультета, для получения необходимых знаний и навыков, подготовлено в крае более 30 учебных баз; практические занятия оснащены самым современным технологическим оборудованием и нормативной документацией, необходимыми для проведения практических занятий.
Студенты факультета активно занимаются научно-исследовательской работой: ежегодно представляют доклады на научно-практических конференциях молодых ученых и студентов юга России в разделе «Профилактическая медицина», конференциях и пленарных заседаниях КубГМУ. Работы шести студентов удостоены Президентского Гранта. Под руководством преподавателей студентами подготовлено и опубликовано более 80 печатных работ, в том числе 10 — в сборниках международных конгрессов.
Высокий уровень теоретических знаний и практических навыков студентов подтверждается результатами государственных аттестационных экзаменов. 180 выпускников факультета успешно работают, решают сложные вопросы санитарно-эпидемиологического надзора, руководят структурными подразделениями ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае» и других субъектах РФ.