Лечебная деятельность ФГБОУ ВО КубГМУ Минздрава России проводится в соответствии с Федеральным Законом № 323-ФЗ от 21 ноября 2011 года «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации», приказом МЗ РФ № 228 от 29 сентября 1993 года «Об утверждении положения о клиническом лечебно-профилактическом учреждении», Уставом ФГБОУ ВО КубГМУ Минздрава России и другими нормативными документами. Сотрудниками университета лечебная и консультативно-диагностическая работа осуществляются на базе Клиники университета оснащенной новейшим лечебно-диагностическим оборудованием, а также на 150 медицинских учреждениях Краснодарского края, включая ведущие краевые клиники и Центры.
Профессорско-преподавательский состав клинических кафедр, врачи Клиники вуза, являются высококвалифицированными специалистами в своей области, имеющими сертификаты на право ведения медицинской деятельности и квалификационные категории. Часть высококлассных специалистов университета включены в реестр экспертов качества медицинской помощи территориального фонда обязательного медицинского страхования Краснодарского края, в реестр экспертов территориального органа Росздравнадзора по Краснодарскому краю, в список главных внештатных специалистов по медицинскому обслуживанию населения Министерства здравоохранения Краснодарского края.
ФГБОУ ВО КубГМУ Минздрава России участвует в выполнении государственного задания на оказание высокотехнологичной медицинской помощи гражданам Российской Федерации по разделам: акушерство-гинекология и стоматология.
Клинические кафедры университета оказывают содействие в реализации программ по охране и укреплению здоровья населения Краснодарского края, вопросах пропаганды здорового образа жизни, методическую помощь органам практического здравоохранения.
Контроль и анализ медицинской деятельности университета возложен на клинической отдел, организованный в 1994 году. К основным задачам отдела относятся: контроль и анализ лечебной работы клинических кафедр и лечебно-профилактических структурных подразделений вуза, организация медицинских осмотров сотрудников, заключение договоров о совместной деятельности университета с организациями и учреждениями практического здравоохранения в целях улучшения качества медицинской помощи населению.
